购买时应分别查看取得税和登记费用
房地产取得税是都道府县征收的地方税，登记许可税则是办理所有权转移或抵押权设立登记时产生的国税。应税标准可能与买卖价格不同。住宅和土地的减免措施通常有适用期限，以及面积、建造年份等条件，因此不要直接套用旧版汇总表中的优惠税率。
持有期间应确认固定资产税缴税通知书
原则上，固定资产税向每年 1 月 1 日登记簿上的所有者征收。标准税率和城市规划税上限会因地方政府条例不同而在实际适用上有所差异。住宅用地优惠和新建住宅减税也有相应条件和期限，请确认所在地地方政府出具的课税明细。
出售时，判断持有期间的日期很重要
如果在出售土地和建筑物当年的 1 月 1 日，持有期间超过 5 年，则归类为长期资本利得；持有期间为 5 年或以下，则归类为短期资本利得。长期和短期适用的普通税率不同，还需一并考虑复兴特别所得税和居民税。如果没有取得费用和出售费用的凭证，应税所得的计算结果可能会有所不同。
自住房 3,000 万日元扣除并非自动适用
出售符合条件的自住房时，无论持有期间长短，都有从资本利得中最多扣除 3,000 万日元的优惠政策。如果实际资本利得低于扣除上限，只能扣除实际金额；同时还必须满足居住情况、出售时间等条件，并提交确定申报。还应确认家庭成员之间的交易以及与其他优惠政策是否存在重复适用。
继承和赠与应与交易税分开处理
继承税和赠与税不仅根据一项房地产计算，还会综合考虑其他财产、债务和家庭关系。不能只看继承税的基础扣除额或赠与税的年度扣除额，就断定是否需要缴税。如果属于非居民，或在韩国和日本两国都存在纳税关系，可能需要分别咨询两国的专业人士。